学术研究是医学院学科建设的根本。基础医学院有着优秀的学术研究传统，近五年来，学院围绕学科建设，瞄准前沿，凝练方向，学院教师主持校级课题15项，经费57.68万元；主持或参与校级以上科研课题11项，经费约141.5万元，其中包括参与国家自然基金面上项目等高级别的科研课题；以第一作者发表的自然科学的核心期刊论文19篇，发表或参与发表SCI论文29篇，其中有8篇是以第一作者身份发表，影响因子4分以上有3篇。学院已经完成200平米的科研平台建设，可容纳更多的师生参与科研实验。
为进一步活跃学院的学术氛围，基础医学院于2018年3月起，每周二下午2点半，举办学术沙龙活动，对全院乃至全校相关领域的师生开放。学术沙龙的主要参与人是来自我院科研平台的老师、研究生和参与创新项目的本科生，内容主要由文献学习，工作进展汇报，课题讨论等内容组成，旨在提供一个交流平台，使学院不同研究领域的师生能畅谈交流，碰擦出科研灵感和火花，分享成功的经验和失败的体会，促进学院师生之间的交流合作，和学科交叉融合。同时，学术沙龙也是培养研究生和本科生科研素养，培育学生创新项目重要的第二课堂。（基础医学院）
